تشير مهمة الإخلاء المميتة إلى تحول في حرب ماستر شيف مع كوفينينت. في أون رييتش، يتولى نظام جديد زمام الأمور في فليتكوم. يشعر جون بوجود تهديد وشيك بالقرب من الديار

يدفع جون، سيلفر تييم إلى أقصى حدوده أثناء بحثه عن الـ سبارتانز المفقودين؛ كاي قلق بشأن ثبات جون. يكتشف كوان أن رابيل مكان أكثر خطورة في غياب سورين. تبحث هالسي عن هوية الشخص الذي أسرها.

يشرع جون وفريق سيلفر في مهمة غير مصرح بها. يجب على لايرا وكوان وكيسلر الهرب من طاقم سورين المتمرد. يتلقى أكرسون معلومات استخباراتية مقلقة من كورتانا. التهديد بالهجوم يجبر أكرسون على اتخاذ قرار لا رجعة فيه.

يهدد هجوم الكوفينانت أهم معقل للإنسانية. يحارب جون وبيريز وسيلفر تيم عدو قوي. الأدميرال كييز يحشد قوات مجلس الأمن التابع للأمم المتحدة لاتخاذ موقف نهائي. يقيم هالسي وسورين ارتباط غير متوقع أثناء محاولتهما الهروب من الأسر.

عقب الهزيمة، يكافح الناجون من أجل جمع أنفسهم. على كوكب أليريا المقفر، يعاني جون من خسارة غير مسبوقة. يبحث سورين ولايرا عن ابنهما المفقود. تكون ماكي حذرة بعد نفاذ صبر أربيتار.

يسعى جون للانتقام من كوكب أوني السري. يتدرب بيريز ليصبح جندياً من نوع جديد. تجد كاي نفسها محتارة بين عملها كسبارتن وبين ولائها لماستر تشيف. تلجأ ماكي إلى كورتانا للحصول على المساعدة في بحثها عن هالو.

يتواجه جون-117 وجهاً لوجه مع ماكي. يقود اكتشاف ما إلى تشكيك أكرسون في ولاءاته. تبدأ علاقة سورين ولايرا في الانهيار. يعمل كل من هالسي وكوان وميراندا على حل اللغز.

تبدأ المعركة المهمة من أجل هالو. يتخذ جون خيار مصيري. يقوم كل من سورين وكوان بمهمة الإنقاذ. تطلق هالسي وميراندا العنان لرعب قديم.